此病在各银杏育苗区均普遍发生。多出现于12年生的银杏实生苗木，尤以一年生苗木更为严重，常造成幼苗大量死亡。
2症状：发病初期幼苗基部变褐，叶片失去正常绿色，并稍向下垂，但不脱落。感病部位迅速向上扩展，以至全株枯死。病苗基部皮层出现皱缩，皮内组织腐烂呈海绵状或粉末状，色灰白，并夹有许多细小黑色的菌核。此病病菌也能侵入幼苗木质部，因而褐色中空的髓部有时也见小菌核产生。尔后病菌逐渐扩展至根，使根皮皮层腐烂。如用手拔病苗，只能插入木质部，根部皮层则留于土壤之中。银杏扦插苗在高温或低温的条件下，茎腐病也能发生，可使插穗表皮呈筒状套在木质部上，韧皮部薄摆组织则全部发黑腐烂。
3病原菌：银杏茎腐病的病原菌为球壳孢目、球壳孢科，大茎点属的炭腐病菌MacrophomiaphaoliMaublAshby此菌喜高温，适宜。生长温度为3032℃；而对酸碱度要求不严，pH49之间均能很好生长。
4发病规律：茎腐病菌通常在土壤中营腐生生活，属于弱寄生真菌。适宜条件下自苗木伤口处侵入。因此，病害发生与寄主和立地环境条件有关。苗木受害的根本原因是由于地表温度过高，苗木基部受高温灼伤后造成病菌侵入。苗木木质化水平越低此病的发病率越高。苗床低洼积水时，发病率也明显增加。银杏扦插苗，68月份当苗床高温达30℃以上时，插后10l5d即开始发病，严重时大面积接穗发黑死亡。试验证明，拮抗性放线菌能有效的抑制该病病菌的蔓延扩散。
5防治方法根据银杏茎腐病发病的原因，目前应以预防为主。
A.提早收获争取土壤解冻时即行播种，此项措施有利于苗木早期木质化，增强对土表高温的抵御能力。
B.合理密播密播有利于发挥苗木的群体效应，增强对外界不良环境的抗力。试验证明，苗木密度愈小发病率愈高，密度愈大发病事愈低。实践还证明，过去每亩收获2540kg种子，如改为每亩80l00kg种子的收获量之后，不只发病率降低，而且单位产苗量增加，既节约了土地又减少了发病。
C.防治地下害虫苗木受地下害虫的危害之后；极易为茎腐病菌所感染，因此，收获前后一定要时刻注意消灭地下害虫。
D.防止苗木的机械损伤当年生收获苗或一年生移植苗在松土除草或起苗栽植过程中一定要注意不要损伤苗木的根茎，否则极易引起茎腐病的发生。
E.遮荫降温为防止太阳辐射地温增高，育苗地应采取搭荫棚、行间覆草、种植玉米，插枝遮阳等措施以降低对幼苗的危害。
F.灌水喷水在高温季节应及时灌水喷水以降低地表温度，有条件的地方可采取喷溉，更有利于减少病害的发生。
G.药物和生物防治结合灌水可喷洒各种杀菌剂如托布津、多菌灵、波尔多液等。也可6月中旬追施有机肥料时加入拮抗性放线菌，或追施草木灰／过磷酸钙（10.25并加入拮抗性放线菌.
